近日,中南大学湘雅三医院移植中心明英姿教授采用新格元单细胞测序技术在《Immunology & Cell Biology》上发表血吸虫病肝纤维化的单细胞转录组测序文章,题为:A preliminary investigation into the immune cell landscape of schistosome-associated liver fifibrosis in humans。文章采用6例人肝脏组织,利用新格元自主研发的GEXSCOPE®海量单细胞测序技术,成功获得了高质量的单细胞测序数据,有助于揭示人类血吸虫病肝纤维化的潜在免疫机制。
研 究 背 景
血吸虫病是一种广泛传播的寄生虫病,晚期血吸虫病常发展为血吸虫病肝纤维化,其发病机制尚不清楚且缺乏有效的治疗方法。近期研究表明,多种免疫细胞与血吸虫病肝纤维化的发生有关。然而,动物模型中免疫细胞的功能和表型的多样性,甚至基于人类外周血的分析,也都无法完全反映和揭示肝脏浸润免疫细胞的表型和功能。因此,阐明其背后的免疫机制,进一步了解其免疫状况不仅可以更好地了解血吸虫病肝纤维化的预防和控制,还可以为其他类型的纤维化的治疗提供思路。
方 法 流 程
文章从3例慢性乙肝肝衰竭患者(Chronic liver failure,CLF),1例日本血吸虫合并乙肝患者(Schistosomiasis japonicum,SJ)和2例正常组(Healthy control,HC)的肝脏中分离出单个细胞,在低速离心移除肝细胞后,将肝脏的非实质细胞(non-parenchymal cells,NPCs)进行scRNA-seq处理,并对所得数据进行进一步的生物学分析。
实 验 结 果
图一 3组样本的单细胞图谱绘制
2. CAVIN2+巨噬细胞促进日本血吸虫病肝纤维化
图二 3组样本的MPs图谱绘制
图三 3组样本的T细胞图谱绘制
文章检测到7,392个T细胞,将其分为10个主要的集群。SJ组主要由T细胞(1)和T细胞(3)组成,是GZMB的重要来源;HC组主要由T细胞(4)组成;CLF组主要由T细胞(0)和T细胞(2)组成。同时,对T细胞(1)和其他集群之间的差异表达基因进行KEGG通路分析,结果表明,T细胞(1)主要与NK细胞介导的细胞毒性通路有关。
图四 3组样本的DCs图谱绘制
5. SJ组的其他免疫细胞
图五 3组样本的B细胞、中性粒细胞和NK细胞图谱绘制
此外,文章还探索了其他免疫细胞。将1,198个B细胞分成4个亚簇。SJ组主要由B细胞(0)组成;CLF组主要由B细胞(0)和B细胞(1)组成;HC组主要由B细胞(2)和B细胞(3)组成。将952个中性粒细胞分为4个亚簇,SJ组以中性粒细胞(0)为主;CLF组以中性粒细胞(0)和中性粒细胞(1)为主;HC组以中性粒细胞(0)、中性粒细胞(2)和中性粒细胞(3)为主。将2,231个NK细胞分成5个簇,NK(0)和NK(2)是SJ组的主要亚簇;CLF组主要由NK(0)、NK(1)和NK(2)组成;HC组主要由NK(3)组成。
结 论
本文首先应用scRNA-seq描绘了血吸虫病肝纤维化的肝脏免疫细胞图谱,同时反映了SJ,CLF和HC组之间肝脏浸润免疫细胞的异质性。这一初步研究表明,具有独特标记基因表达和特异性信号通路激活的肝脏浸润免疫细胞可能有助于我们了解血吸虫病肝纤维化的机制。
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