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单细胞转录组测序单细胞核转录组测序免疫受体测序生信分析

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新格元提供从样品制备到定制数据分析的完整的单细胞解决方案,突破了常规单细胞测序技术在周期、通量和成本等方面的瓶颈,为单细胞分析技术在临床检测上的应用扫除障碍.

新格元单细胞测序实验流程及优势
新格元单细胞测序案例展示

单细胞测序揭示LUAD中同步GGNs对抗PD-1/PD-L1治疗不敏感原因

  • 208名接受抗PD-1/PD-L1治疗的LUAD患者

    筛选出18名患者的37例同步GGNs

    GGNs经治疗后的形态学变化

    原发灶和GGNs间细胞比例差异

    单细胞RNA测序

    2名患者原发肺肿瘤和配对的GGNs活检样本

    免疫组化验证细胞比例差异

    在GGNs中,肿瘤相关巨噬细胞比例较高,CD8+T细胞比例低,可能与不良预后和治疗不敏感相关

    选用匹配的原发性肺癌(PL)和 同步毛玻璃结节(GGNs)肺癌的活检样本进行分析,鉴定出11种主要的细胞类型。原发性肺癌和同步GGNs样本之间的免疫细胞差异很大

    免疫组化证实,与原发灶相比,同步GGNs样本中CD68+ TAMs比例高的多,TAMs的存在与不同类型癌症的不良预后相关

    同步GGNs样本中CD8+ T细胞比例明显低于原发性肺癌,免疫浸润较低,可能是GGNs对抗anti-PD1/PDL1治疗反应低的潜在原因之一。

    Synchronous ground-glass nodules showed limited response to anti-PD-1/PD-L1 therapy in patients with advanced lung adenocarcinoma. Clin. Transl. Med. 2020;e149. IF:5.16

    结论

    首次报道了晚期肺腺癌(LUAD)中合并肺部毛玻璃结节(GGNs)的患者可能对抗PD -1/PD-L1的单一治疗或联合治疗不敏感,37例GGNs中,仅有3例(8.1%)对PD-1/PD-L1治疗有反应。提出合并肺部毛玻璃结节疾病应谨慎使用抗 PD1/PD-L1 进行基础治疗,在此临床情境中应考虑其他针对同步GGNs的治疗策略。

  • 首次使用单细胞测序技术研究骨肉瘤,通过分析基因表达图谱,对骨肉瘤组织细胞进行精细分型。

    Zhou, Y. et al. Single-cell RNA landscape of intratumoral heterogeneity and immunosuppressive microenvironment in advanced osteosarcoma. Nature Communications.

    利用新格元公司平台技术解离了骨肉瘤7个原发灶、2个复发灶和2个肺转移灶组织,并通过单细胞测序技术获得解离后共100,987个单细胞的转录组信息。通过聚类得到11个主要的细胞类型。

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