SynEcoSys®单细胞数据库内置标准化单细胞数据集,并配置CeleViz®数据可视化和CeleLens(Lite)自动分析模块,为研究人员提供了界面版一站式的单细胞数据挖掘平台。
目前,SynEcoSys®单细胞数据库已完成主要版本升级,满足更多数据分析挖掘需求。可登录网站www.synecosys.cn注册获得免费试用账号。
一、SynEcoSys®v1.1版本,新增亮点功能
1、 细胞互作分析
2、拟时序轨迹分析
3、 细胞亚型自动分析注释
用户在SynEcoSys®自动分析后,提供大类细胞类型自动注释、细胞细分亚群和免疫细胞亚型自动注释。自动注释提供最优细胞类型和其他参考,也可自定义命名。细胞亚型鉴定在单细胞测序技术中是一个非常重要的步骤。例如在肿瘤研究中,免疫细胞亚型的特异性通常与关键性结果相关,进而可深入探究肿瘤微环境的复杂性和异质性。
4、目标基因和细胞类型Bulk RNA数据分布
用户在SynEcoSys®中,可从细胞系,组织和肿瘤层面,查看不同bulk RNA数据库中基因表达分布情况,横向比较目的基因单细胞测序和bulk RNA测序数据,挖掘基因在不同分析层级中的表达差异。
SynEcoSys®将单细胞数据与临床表型关联,实现单细胞数据的临床转化应用,解决现阶段单细胞数据库缺乏临床信息的主要痛点。
SynEcoSys®完整标准化的数据过滤分析流程,标准化命名处理和统一的注释细分层级,解决不同注释层级单细胞数据的跨来源比对和搜索难题。
SynEcoSys®组织图谱涵盖人、小鼠、非人类灵长动物12大功能系统的50余种器官类型,收录大于4000个独家转录marker知识库,更便于操作和查找,助力数据挖掘和细胞注释。
SynEcoSys®预先整合热门疾病的大量临床样本数据,覆盖全面的临床疾病分期、分型、携带突变、全面的临床治疗方法、治疗反应等,实现跨来源样本直接比对。
SynEcoSys® Database-wise Distribution可查看基因和细胞类型在关联的组织类型,疾病/正常样本中的表达排名,并可比对单细胞测序和Bulk RNA测序数据,协助锁定研究方向。
SynEcoSys®配备CeleLens(Lite)自动分析注释工具和CeleViz®可视化工具,实现单细胞数据自动化分析、注释和可视化,助力单细胞数据探索和挖掘。
另外,我们重磅推出 New!CeleViz Browser!
作为客户福利,CeleViz® Browser将对已获得新格元下机矩阵的客户免费使用!在保障您数据隐私和安全的前提下,让您可以随时进行基础的探索分析,充分挖掘所得数据,省去委托分析的等待时间!可联系咨询所在地的新格元销售获取下载方式。
另外,SynEcoSys被添加在Human Cell Atlas data portal的Analysis Portals中啦!注册就现在,赶快行动吧!
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