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新品上市 | ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化解决方案
发布时间:2022-10-21 13:57:56  

“构建糖基化图谱,解锁单细胞新边界”

 

一、背景

 

糖基化作为一种常见的蛋白翻译后修饰,在真核细胞中广泛存在,不同细胞类型的糖基化在类型和数量上也有较强的异质性。在糖基转移酶作用下将糖类转移至蛋白质,与蛋白质上特殊的氨基酸残基形成糖苷键是糖基化的基本过程。细胞膜表面的糖基化可以增加膜蛋白的稳定性,也是细胞膜表面信号的特征之一。

图自Glycosylation in cancer: mechanisms and clinical implications

 

在组织和细胞中,糖基化主要参与调控蛋白质的定位、功能和活性,影响细胞识别、分化、信号转导、免疫应答等多种重要的生命活动。糖基化异常可导致肿瘤、糖尿病、心血管和神经退行性疾病等多种病症。比如,与正常细胞相比,肿瘤细胞表现出广泛的糖基化改变,进而增加肿瘤异质性,还可以通过聚糖结合受体诱导免疫抑制信号。又或者,体内的葡萄糖分子或其他糖类分子错误地连接到蛋白质上,会引起蛋白质变性,这一有害反应与氧化反应类似,也是引发糖尿病并发症的重要因素。

 

二、产品介绍

 

ProMoSCOPE™单细胞糖基化检测试剂盒,是在单细胞分辨率下同时检测单细胞转录组和细胞表面糖基化的商业化产品。基于酶促糖基化原理,在测序前经过糖基转移酶连接Tag,使用Singleron Barcode Beads可完成对单细胞tag标签及转录组的捕获,通过标签文库及转录组的联合分析,可同时获得单样本的细胞转录组信息及细胞糖基化信息。

ProMoSCOPE™原理图

 

ProMoSCOPE™具有简单的工作流程,可同时分析数千个细胞的糖基化水平,适用于疾病机制和肿瘤侵袭、肿瘤异质性研究、免疫应答研究和宿主-病原体相互作用等方向的研究。

ProMoSCOPE™流程图

 

基于新格元一站式单细胞系统,ProMoSCOPE™拥有从样本制备到数据分析的完整流程:

⚪利用ProMoSCOPE™连接样本细胞,使其携带特异的Tag barcode信息,再利用GEXSCOPE®微流控芯片捕获单细胞。

⚪细胞裂解后,GEXSCOPE®分子标签磁珠通过捕获成熟mRNA末端的poly-A,使细胞内mRNA和Tag barcode被加上相同的Cell Barcode。

⚪逆转录成cDNA之后,分别进行Tag标签文库及单细胞转录组文库的构建,上机测序。

⚪得到下机数据,用开源软件CeleScope®进行分析,定量后得到样本的糖基化水平及单细胞转录组信息。

 

三、亮点

 

选择新格元ProMoSCOPE™,您可以得到:

⚪组分全面:试剂盒包含转录组建库试剂组分及糖基化标记及建库组分,无需购买额外的试剂。

⚪单细胞多组学:同时获得单细胞转录组和糖组学信息。

⚪高覆盖率:定量多种糖基化信息。

 

四、数据展示

 

1.糖基化标记对细胞转录组数据无影响

采用正常小鼠骨髓细胞分别进行单细胞转录组建库(Control M)和单细胞糖基化检测试剂盒建库(FUT_M),两组数据在细胞图谱与细胞类型比例上保持一致。

2.获得细胞聚类信息的同时,得到糖基化图谱信息

在细胞图谱上映射糖基化信息,可以看到细胞类型特异糖基化丰度,进一步刻画细胞异质性。如图所示,在测试数据中细胞Neutrophils、Monocytes、HSCs、BCells、Macrophages、Basophils糖基化水平高于GMP、ProEryth、TCells。

 

五、应用场景

 

1.肿瘤异质性研究

轻松建立单细胞糖基化图谱,辅助细胞亚型细分,探究细胞糖基化异质性。

2.免疫应答研究

免疫微环境糖基化研究,探索抗原识别与递呈糖基化关系,研究细胞状态特异的糖基化丰度。

3.发育研究

研究发育轨迹中的糖基化趋势,遗传失常糖基化研究。

4.药物研发与标志物检测

疾病标志物糖基化探究,糖免疫药物开发。
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