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自动化仪器
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GEXSCOPE® 单细胞转录组建库试剂盒 GEXSCOPE® 单细胞核转录组建库试剂盒 GEXSCOPE® 单细胞免疫受体建库试剂盒 sCircle® 单细胞全长免疫受体试剂盒 GEXSCOPE® 微生物单细胞酵母试剂盒 DynaSCOPE® 单细胞转录动态监测试剂盒 CLindex® 单细胞多样同测试剂盒 FocuSCOPE® 单细胞多组学 mRNA x克隆造血试剂盒 FocuSCOPE® 单细胞肺癌靶向基因突变检测试剂盒 FocuSCOPE® 单细胞EB病毒基因检测试剂盒 FocuSCOPE®单细胞血液肿瘤靶向基因突变检测试剂盒 ProMoSCOPE®高通量单细胞糖基化检测试剂盒
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SCOPE-chip微流控芯片 什么是CeleScope® ? CeleScope®软件安装 FocuSCOPE® 靶向高通量单细胞测序
CLindex®单细胞多样同测试剂盒基于化学基团共价结合细胞膜表面蛋白的原理，可实现多样本标记；提供16种样本标签，可实现一次实验16个样本的多样同测，进一步提升样本检测通量。 产品可搭配GEXSCOPE®单细胞转录组试剂盒，可完成单细胞分离到测序文库构建的全部实验流程，可用于多样本平行研究，提升单细胞样本检测通量。
图1 样本标记原理图
1、 利用CLindex®标记不同样本的细胞，使其携带特异的Sample index信息，混合后利用GEXSCOPE®微流控芯片捕获单细胞。
2、 细胞裂解后， GEXSCOPE®分子标签磁珠通过捕获核酸末尾的poly-A，使细胞内mRNA和Sample index被加上相同的Cell Barcode。
3、 逆转录成cDNA之后，分别进行样本标签文库及单细胞转录组文库的构建，上机测序。
4、 测序后通过生信分析按照样本标签信息进行样本拆分，得到各样本的单细胞表达量信息。
图2 多样同测工作流程图
使用4种不同的CLindex®标签分别标记小鼠骨髓样本，混合后进行转录组文库及标签文库的构建，经样本标签拆分后，获得的细胞图谱能很好的重叠，细胞类型占比与未标记组相同。
使用CLindex®对人急性淋巴白血病细胞系CCRF(上侧)和小鼠睾丸(下侧)进行多样本标记，混合后通过高密度芯片进行细胞分离，分别构建两库后进行测序，最后通过样本标签信息进行样本拆分。结果显示，CLindex®对同类型样本的标记无差异，并能实现跨物种标记，物种间区分度高。
对四种细胞系样本(U937, NB4, CCRF-CEM和THP-1)用标签 A-D进行条形码编码，然后合并在一起，进行scRNA-seq测序(A)。基于转录组的单细胞表达谱聚类显示了不同的细胞类型：CCRF-CEM(红色)，NB4(蓝色)，THP-1(黄色)和U937(暗红色) (B)。将标签数据集投影到单细胞类型上 (C)。4个细胞系上缩放(z-scores)标准化标签的热图(D)[1]。
[1]Zhao, X.; Sun, S.; Yu, W.; Zhu, W.; Zhao, Z.; Zhou, Y.; Ding, X.; Fang, N.; Yang, R.; Li, J.; Improved ClickTags enable live-cell barcoding for highly multiplexed single-cell sequencing, RSC Chem. Biol. 2022, 3, 1052–1060.
