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GEXSCOPE®单细胞免疫受体建库试剂盒

GEXSCOPE®单细胞免疫受体建库试剂盒,可用于快速构建单细胞转录组测序文库和单细胞免疫受体测序文库,适用于在单细胞水平对免疫组库进行研究。该试剂盒使用带有靶向TCR/BCR恒定区探针的分子标签磁珠,特异性捕获TCR/BCR的mRNA分子,能有效提高TCR/BCR的捕获效率。

靶向探针和特异性捕获原理

GEXSCOPE®单细胞免疫受体建库试剂盒中,其分子标签磁珠即带有两种不同的寡核苷酸序列,其中带有poly T的寡核苷酸分子可与mRNA分子3’端polyA结合,无差异性捕获所有的mRNA分子,用于构建转录组测序文库;带有特异性探针的寡核苷酸序列可靶向TCR/BCR恒定区,特异性捕获TCR/BCR的mRNA分子,用于构建免疫受体测序文库。

免疫受体文库的高效捕获

基于特异性靶向TCR/BCR分子恒定区的探针结构,能在核酸捕获的源头阶段就大幅度提高TCR/BCR的mRNA分子被捕获率,因此利用GEXSCOPE®单细胞免疫受体建库试剂盒构建的免疫受体测序文库中, TCR/BCR分子多样性、单细胞转录本绝对值、单细胞重轻链匹配度均处于较高水平。

使用GEXSCOPE®单细胞免疫受体建库试剂盒捕获PBMC样本中的TCR分子,免疫受体文库中TCR的α和β链的配对率高达82.57%,Reads中 匹配到V(D)J基因的占比高达99%。

应用方向

GEXSCOPE®单细胞免疫受体建库试剂盒可用于从单细胞层面解析机体或组织内TCR/BCR分子种类,丰度以及变化情况,从而进一步探究特异性免疫系统与肿瘤、免疫疾病、病毒感染的关系。

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