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SCOPE-chip™ 微流控芯片CeleScope™ 分析软件sCelLiVE™ 组织保存液和解离液FocuSCOPE™ 靶向高通量单细胞测序

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CeleScope™ 分析软件

CeleScope™ 是由Singleron开发的一组生物信息学分析流程,用于处理Singleron产品生成的单细胞测序数据。这些流程将双端 FASTQ 文件作为输入并生成可用于下游数据分析的文件和QC指标。 目前,CeleScope™包括以下流程:

*celescope rna 用于使用GEXSCOPE®单细胞测序试剂盒生成的单细胞RNA-seq数据。它执行预处理、基因组比对、特征计数、表达矩阵生成、聚类、差异基因表达分析和细胞类型分配(可选)。

*celescope vdj 用于使用GEXSCOPE®单细胞免疫受体建库试剂盒生成的单细胞免疫组库数据。它执行预处理、生成UMI一致性序列、VDJ序列比对、UMI过滤和克隆类型计数。

*celescope tag 用于使用CLindex™单细胞多样同测试剂盒生成的单细胞混样数据。它执行预处理、标签计数、标签分配和双细胞识别。

*celescope dynaseq 用于使用DynaSCOPE™单细胞转录动态监测试剂盒生成的单细胞动态转录组数据。它执行预处理、基因组比对、特征计数、表达矩阵生成、聚类、碱基替换率统计和新生RNA鉴定。

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