新格元DBiT-seq空间转录组解决方案,基于耶鲁大学樊荣教授团队的开创性技术,通过微流控确定性条形码(Deterministic Barcoding),专为临床样本库中常见的FFPE组织优化,深入解析转录组学、基因变异谱及多种非编码RNA等信息,最大化释放临床样本的科研价值。

小鼠脑矢状面FFPE样本--20µm芯片:
| sample | Mouse_Brain_FFPE |
| Raw Reads | 365,762,864 |
| In Tissue Spots | 7,933 |
| Mean Used Reads per Spot | 21,853 |
| Median UMI per Spot | 14,199 |
| Median Genes per Spot | 3,476 |
小鼠脑,细胞聚类和细胞类型注释:

小鼠脑部分特异mRNA 空间表达:


小鼠脑非编码RNA检测:


| 样本类型 | 送样量/样 | 保存条件 | 组织面积 | 运输条件 | 测序类型和数据量 |
| FFPE 蜡块 | 1块 | 密封后,4℃保存 | 组织长、宽均小于4mm;若大于4mm,需告知检测区域(根据HE染色或白片组织划分确定) | 冰袋运输 | PE150,100G/样本 |
注:由于我司采用的是非标准尺寸载玻片,客户可将蜡块寄送至公司,由我司人员进行切片和贴片;或客户拿到我司提供的玻片之后,按照手册自行贴片。
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