靶向高通量单细胞测序

技术背景简介

新格元FocuSCOPE^®靶向高通量单细胞测序基于靶向磁珠完成单细胞mRNA与靶基因转录本的捕获，结合特异性靶基因文库富集流程，有效提高了靶基因表达与突变信息的检测水平。单细胞转录组测序磁珠上的核酸在靶向磁珠中经过编辑修改，将携带靶基因信息的序列设计在磁珠上作为捕获探针，从而实现高效靶基因表达与突变信息捕获。

 

FocuSCOPE^®系列服务接受定制化，可对靶向磁珠探针进行定制，探针可同时靶向5个靶标（不限5‘端与3’端，每个区域小于200 bp）。基于FocuSCOPE^®定制化单细胞测序原理，目前推出三款成型服务分别为：

 

1.FocuSCOPE^®单细胞肺癌靶向基因突变检测；

2.FocuSCOPE^®单细胞EB病毒基因检测；

3.FocuSCOPE^®单细胞血液肿瘤靶向基因突变检测。

 

 

技术流程

 

 

服务优势

 

 

样本要求

 

 

应用方向

 

 

结果展示

 

 

分析条目

FocuSCOPE^®单细胞靶向测序服务系列的分析内容，除单细胞转录组测序的分析条目外，还包括以下分析条目。具体分析内容，以项目合同为准。

FocuSCOPE^®单细胞肺癌/血液肿瘤靶向基因突变检测

 

FocuSCOPE^®单细胞EB病毒基因检测

 

 

FAQ

1、目前新格元的FocuSCOPE^®系列已成型的产品有哪些？

答：目前新格元共推出三款靶向产品，分别是FocuSCOPE^®单细胞肺癌靶向基因突变检测试剂盒、FocuSCOPE^®单细胞EB病毒基因检测试剂盒和FocuSCOPE^®单细胞血液肿瘤靶向基因突变检测试剂盒，除以上三款，我司可提供特定基因的定制化服务。

2、FocuSCOPE^®系列的应用领域主要包括哪些？

答：①基础研究：关联基因型与表达、基因融合位点、病毒整合位点、低表达基因检出；②临床转化：药物作用机理、耐药机制、分子标记开发；③药物开发：靶点验证、高通量筛选、疗效评价等。

3、FocuSCOPE^®系列和GEXSCOPE^®单细胞转录组测序相比，在实验流程上有什么区别？

答：主要区别在于文库构建环节，FocuSCOPE^®系列需要建立两个文库，包括单细胞转录组文库和靶向富集文库，而GEXSCOPE^®只需要建立一个单细胞转录组文库即可。

4、FocuSCOPE^®单细胞靶向探针可以针对哪些靶标进行定制化设计？

答：包括基因突变、融合基因、病毒基因、基因编辑区域、远3‘端区域等。

5、病毒感染后，普通3'单细胞转录组测序可以测到病毒的基因表达吗？

答：如果病毒基因mRNA 3‘端有poly A结构则有可能被捕获到，但这也与病毒基因的表达丰度有关；EB病毒基因检测技术测试显示，使用靶向捕获检测出的病毒基因数明显高于普通单细胞转录组检测。

6、如何提供特定基因探针的定制化服务？

答：客户提供需要定制化的基因序列和ID，由研发人员进行评估。评估可行后，根据基因序列设计特异性探针、制备磁珠，并进行内部测试等。最后用测试合格的产品进行单细胞靶向测序实验。

7、一般靶向富集文库推荐测多少的数据量？

答：关于靶向富集文库，一般推荐测10G的数据量。