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高通量单细胞糖基化测序

技术背景简介

糖基化作为一种常见的蛋白翻译后修饰,在真核细胞中广泛存在,不同细胞类型的糖基化在类型和数量上也有较强的异质性。单细胞测序是研究细胞异质性的科研利器,为了在揭示细胞的异质性的同时研究不同细胞类型的糖基化的变化。单细胞糖基化测序应运而生。ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化测序,是在单细胞分辨率下同时检测单细胞转录组和细胞表面糖基化的技术。基于酶促糖基化原理,在测序前经过糖基转移酶连接Tag,使用Singleron Barcode Beads可完成对单细胞Tag标签及转录组的捕获,通过标签文库及转录组的联合分析,可获得细胞转录组信息及细胞糖基化信息。

 

 

技术流程

 

 

服务优势

 

 

样本要求

 

 

应用方向

 

 

结果展示

在细胞图谱上映射糖基化信息,可以看到细胞类型特异糖基化丰度,进一步刻画细胞异质性。

 

分析条目

ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化测序服务系列的分析内容,除单细胞转录组测序的分析条目外,还包括以下分析条目。

 

 

FAQ

1、ProMoSCOPE™标记细胞时对投入的细胞数有何要求?

答: 一次ProMoSCOPE标记实验推荐的细胞总量为:1*106---5*106,若细胞太少可能存在较大的细胞损失,若细胞量过多则会影响细胞标记效果。

2、ProMoSCOPE™标记细胞物种是否有限制?

答: ProMoSCOPE™目前仅适用于为人(Human)或鼠(Mouse)。

3、ProMoSCOPE™是否需要设置空白对照(不标记细胞)?

答: 一般不需要,ProMoSCOPE™可以对同一样本内的各个细胞亚群的糖基化水平进行相对定量,无需再设置空白对照。

4、ProMoSCOPE™富集文库测序数据量应该如何选择?

答: 推荐测序量为10G,或3000 reads/cells ,可根据期望细胞数进行适当调整。

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