FFPE单细胞核转录组解决方案
技术背景简介
福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）是全球临床病理学中用于组织样本长期保存和归档的金标准。新格元开发的FFPE单细胞核转录组测序产品，采用随机引物的无偏好性技术，对所有细胞核进行高效、均一的逆转录和接头连接，最大程度地将FFPE样本中降解的RNA信息转化为稳定的cDNA分子。随后，基于新格元成熟的微流控系统，高效地为来自单个细胞核的cDNA分子添加细胞来源的身份信息（Barcode）；对FFPE样本、PFA固定样本（新鲜或冻存组织）进行灵活的单细胞分析。
工作流程
技术优势
数据展示
使用小鼠的肾脏、肺、膀胱癌等的FFPE组织样本进行单细胞核转录组测试，经提核获得了形态完整、背景干净的高质量细胞核；随后进行后续实验、测序、分析流程，结果显示基因检出数高，Fraction reads高，背景低。
以小鼠肺FFPE样本为例，成功注释出各样本中不同类型的细胞，且各个亚群分布合理，相临近的细胞类型能很好区分；同时实现对转录本3'至5'端的均匀覆盖。
FFPE样本多路径研究方案
